Il comune di Marnate è parte del Parco del Medio Olona, un’area protetta che si sviluppa attorno al corso dell’Olona e del Tenore per salvaguardare e valorizzare le risorse naturali qui presenti.

Il parco è attraversato da una pista ciclopedonale che segue principalmente l’argine dell’Olona e, in alcuni punti, affianca la vecchia Ferrovia della Valmorea.
Lungo il corso del fiume sono ancora visibili resti di archeologia industriale e mulini, attive sin dal Seicento grazie allo sfruttamento del moto dell’Olona.

Marnate è punto d’arrivo e partenza del sentiero della Nizzolina, che collega il comune con Gorla Minore.
Vi è inoltre il Percorso verde dei fontanili, che consta di due anelli immersi nel bosco alla scoperta del territorio di Marnate, passando per la chiesa di Santa Madonna in Piazza, per la chiesa di Sant’Ilario e per il Lazzaretto.

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