La chiesa dei Santi Pietro e Paolo, citata in documento ecclesiastico di fine Duecento, è probabilmente il primo luogo di culto di Marnate. A conferma di ciò la sua collocazione al centro dell’antico nucleo abitato e la nomina "Madonna in Piazza". L’attuale edificio è però il risultato di una radicale trasformazione avvenuta verosimilmente agli inizi del Seicento.
La chiesa si presenta oggi come un piccolo edificio rettangolare ad aula unica con coro quadrato, coperto da volte a botte e volte a crociera. Addossata al lato nord del presbiterio vi è la piccola sacrestia con il campanile, dotato di un antico orologio meccanico.

Gli esterni sono lasciati in mattoni a vista e presentano ampi finestroni circolari. Semplice la facciata a capanna, in laterizi e con elementi in cotto. La superficie è scandita da alte lesene in laterizio che sostengono il frontone e circoscrivono un alto arco centrale, che ospita l’ingresso e una vetrata. Sopra la porta laterale meridionale si notano i resti di una meridiana.

La chiesetta conserva decorazioni ornamentali rococò sulle pareti interne e un pregevole architrave ligneo con crocifisso. Il presbiterio ospita un importante altare settecentesco in legno, una grande pala con l’Annunciazione e un affresco del XV secolo raffigurante una Madonna col Bambino.
La ricca balaustra di delimitazione è in marmi policromi ad andamento curvilineo mentre sotto l’arco di trionfo è posta una bellissima trabeazione in legno dipinto. Realizzata tra la fine del Cinquecento e l’inizio del Seicento, presenta decorazioni ad intaglio a motivi vegetali, testine di cherubini e angioletti a tinte vivaci. Notevole anche la soprastante croce in legno dipinto con bordi dorati.

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